cnr orthopoxvirus variole monkeypoxvirus diagnostic

Table des matières :

– CNR-LE charbon (site de Brétigny-Orge)
– CNR-LE orthopoxvirus (site de Brétigny-Orge)
– CNR arbovirus (antenne de Marseille – IHU Méditerranée Infection)
– CNR paludisme (antenne de Marseille – IHU Méditerranée Infection)

L’IRBA dispose d’une renommée internationalement reconnue dans le domaine recherche et de l’expertise en microbiologie et maladies infectieuses. Cette expertise est valorisée au travers des 4 mandats de centres nationaux de référence (CNR) détenus :

Ces 4 CNR ont 5 missions principales au profit des professionnels de santé et de Santé Publique France :

l’expertise concernant la microbiologie, la pathologie des agents infectieux et leur sensibilité aux agents anti-infectieux ;
la contribution à la surveillance épidémiologique ;
l’alerte par l’information immédiate de l’Institut de veille sanitaire et du ministre chargé de la Santé de toute constatation pouvant avoir des répercussions sur l’état sanitaire de la population ;
le conseil des pouvoirs publics, des agences de sécurité sanitaire et des professionnels de santé ;
la formation des personnels et décideurs en santé publique.

Un réseau de 38 CNR nationaux a été nommé pour la période du 1^er avril 2017 au 31 mars 2022. Sur ces 38 CNR, 4 sont placés sous la responsabilité de l’IRBA (sites de Brétigny-sur-Orge et antenne de Marseille – IHU Méditerranée Infection).

Les 4 directeurs de CNR sont soumis à une déclaration publique d’intérêt, consultable sur le site https://dpi.sante.gouv.fr/dpi-public-webapp/app/home

Centre national de référence-LE Charbon

Le CNR Laboratoire Expert (CNR-LE) Charbon s’engage à assurer les missions définies par le décret n° 2016-806 du 16 juin 2016 relatif aux centres nationaux de référence pour la lutte contre les maladies transmissibles et par l’arrêté du 16 juin 2016 fixant le cahier des charges des centres nationaux de référence pour la lutte contre les maladies transmissibles.

Le CNR Laboratoire Expert Charbon est en cours d’accréditation selon la Norme NF EN ISO 15189_Decembre 2012, sous le n°8-4084.

Le CNR-Laboratoire Expert Charbon a pour mission d’apporter une expertise microbiologique, de contribuer à la surveillance épidémiologique et d’alerter Santé Publique France (SPF) de tout événement inhabituel ou émergent.

Conseils avant l’envoi d’un échantillon :

Informations et recommandations du CNR LE Charbon.

Envoyer un échantillon :

Fiche de renseignements pour le CNR-LE Charbon Dépistage de Bacillus anthracis.

Consentement éclairé relatif aux échantillons biologiques prélevés dans le cadre du diagnostic du « charbon ».

Adresse de livraison :

CNR-LE – CHARBON
Institut de Recherche Biomédicale des Armées
Département de Microbiologie et Maladies Infectieuses.
Unité de bactériologie
1 Place Valérie André
91220 Brétigny sur Orge
Tel : 06 30 55 70 15

courriel : irba-cnrlecharbon.accueil.fct@def.gouv.fr

Horaires ouvrables : Du lundi au vendredi : de 8h00 à 16h20.

Vous trouverez ci-dessous les documents téléchargeables :

– Consentement au prélèvement

– Fiche de renseignement Bacillus anthracis

– Informations et recommandations du CNR Charbon

Centre national de référence-LE des Orthopoxvirus

Du 21/12/2022 au 01/01/2023 la réception d’échantillons ne sera pas assuré en raison de la fermeture du site de l’IRBA. L’astreinte téléphonique 06 03 87 58 59 est maintenue. La réception des échantillons sera à nouveau fonctionnelle le 02/01/2023.

Le Centre national de référence laboratoire expert (CNR-LE) Orthopoxvirus s’engage à assurer les missions définies par le décret n° 2016-806 du 16 juin 2016 relatif aux centres nationaux de référence pour la lutte contre les maladies transmissibles et par l’arrêté du 16 juin 2016 fixant le cahier des charges des centres nationaux de référence pour la lutte contre les maladies transmissibles.

Le CNR-Laboratoire Expert des Orthopoxvirus est accrédité selon la Norme NF EN ISO 15189 Decembre 2012, sous le n°8-4084.

Utilisation de la marque COFRAC (document GEN REF 11). Le laboratoire n’autorise pas ses clients à faire usage de la marque COFRAC ni de reproduire la marque sur un de leur document.

Le CNR-Laboratoire Expert Orthopoxvirus s’attache à l’identification et la surveillance des souches d’orthopoxvirus, mais également de parapoxvirus, de molluscipoxvirus ainsi que de yatapoxvirus.

Informations :

Conseils avant l’envoi d’un échantillon : Contrat Clinico-Biologique mandat 2017-2021 ; Fiche conseil de prélèvement.

Envoyer un échantillon :

La fiche patient doit accompagner l’échantillon.

Adresse de livraison :

CNR-LE – Orthopoxvirus
Institut de Recherche Biomédicale des Armées
Unité de Virologie
1 Place Valérie André
91220 Brétigny-sur-Orge
Tel : 06 03 87 58 59

courriel : irba-cnropv.accueil.fct@def.gouv.fr

Horaires ouvrables : Du lundi au vendredi : de 8h00 à 16h20.

Vous trouverez ci-dessous les documents téléchargeables :

– rappel des missions du CNR ;

– le formulaire de réclamation.

rapports des tests moléculaires :

– Liste des PCR MPXV

– Rapport 11072022_Kit EBX-060_FT_EurobioPlex Monkeypox v1.00_Eurobio ;

– Rapport 07072022_bioPerfectustechnologies, Monkeypox Viral Real Time PCR Kit_r-biopharm ;

– Rapport 11072022_Monkeypox virus Nucleic Acid Diagnostic Kit (PCR-Fluorescence Probing)_Noveox ;

– Rapport 11072022_Detection Kit for Monkeypoxvirus (MPV) DNA (Lyophilised)_primadiag ;

– Rapport 26072022_Monkeypox virus nucleic acid detection kit (Fluorescence PCR method)_Primadiag ;

– Rapport 26072022_Kit FlexStar_Monkeypoxvirus PCR Detection Kit Mix 1.5_ALTONA ;

– Rapport 09082022_MplexMonkeypox, Orthopox Real-time PCR_GoldStandardDiagnostic ;

– Rapport 10082022_Kit de détection du virus Monkeypox (PCR par fluorescence)_LabNephrotek ;

– Rapport10082022_iSolutions MonkeyPox Fullplex qPCR_ id solutions ;

– Rapport 11082022_Monkeypox virus Real-time PCR Kit, RUO_NZYtech ;

– Rapport 11082022_Bosphore Monkeypoxvirus Detection Kit V1_LAUNCHDiagnostics.

– Evaluation QIASTAT-DX MPXV 01092022

– Rapport Final NeumoDx MPXV 22092022

– Rapport 07092022_Monkeypox Virus Real Time PCR Kit_Vitro S.A

– Rapport 14092022_DIMonkeypoxvirusDuplex_InnovativeDiagostics

– Rapport 14092022_Monkeypox Virus Nucleic Acid Detection Kit_BGI

– Rapport 14092022_Monkeypox Virus Real Time PCR Kit_Bioantibody_ABL

– Rapport 14092022_UltraGene Assay MonkeypoxScreening_ABL

– Rapport 23092022_NeumoDX Monkeypoxvirus_QIAGEN

– Rapport 23092022_QIASTAT-DX Monkeypoxvirus_QIAGEN

– Rapport 13102022_Kit_Viasure_Real Time PCR

– Rapport 13102022_Monkeypox Virus qPCR Kit_TAKARA

– Rapport 19102022_Real Time PCR Kit for Detection of Monkeypox Virus_bio2fil

– Rapport 27102022_DI Monkeypox Virus Freeze-Dried Duplex_InnovativeDiagnostics

– Rapport 27102022_MonkeypoxvirusNucleicAcidDetectionKit_VAROLMEDICAL

rapports d’activité :

– rapport d’activités 2012 ;

– rapport d’activités 2013 ;

– rapport d’activités 2014 ;

– rapport d’activités 2012/2015 ;

– rapport d’activités 2016 ;

– rapport d’activités 2017 ;

– rapport d’activités 2018 ;

– rapport d’activités 2019 ;

– rapport d’activités 2020.

Centre national de référence des Arbovirus

Les maladies virales transmises par les arthropodes hématophages (arboviroses) rassemblent un grand nombre de pathologies pouvant affecter différentes espèces animales et/ou l’homme. L’impact en santé publique et les répercussions économiques peuvent être conséquentes, comme illustré par plusieurs années consécutives d’émergences arbovirales majeures (Dengue, Chikungunya, Zika, West Nile). Ces émergences ont également montré le potentiel d’expansion extraordinaire des zones de circulation géographique des virus concernés, représentant un défi majeur pour les dispositifs de surveillance et d’alerte nationaux, ainsi que pour la gestion du risque vectoriel.

Le laboratoire est composé de 10 personnes, 4 cadres et 6 techniciens, militaires et civiles, sous la direction d’Isabelle Leparc-Goffart. Il représente l’antenne Marseillaise de l’Unité de Virologie du Département de microbiologie et maladies infectieuses de l’Institut de recherche biomédicale des armées (IRBA), qui dépend lui même du service de santé des armées.

Informations :

Site du centre national de référence Arbovirus – https://www.cnr-arbovirus.fr/www/

Centre national de référence du paludisme

Le Laboratoire associé au Centre national de référence du paludisme s’engage à assurer les missions définies par le décret n° 2016-806 du 16 juin 2016 relatif aux centres nationaux de référence pour la lutte contre les maladies transmissibles et par l’arrêté du 16 juin 2016 fixant le cahier des charges des centres nationaux de référence pour la lutte contre les maladies transmissibles.

Le Laboratoire associé au Centre national de référence du paludisme assure la confirmation du diagnostic dans le cas de difficultés diagnostiques microscopiques, d’espèces non falciparum, ou d’association d’espèces. Il assure également le développement et l’évaluation de nouvelles techniques de diagnostic (test de diagnostic rapide, biologie moléculaire), le phénotypage des isolats de P. falciparum et l’étude des marqueurs moléculaires de résistance aux antipaludiques des isolats reçus dans le cadre de la surveillance de l’efficacité des antipaludiques, la cryoconservation des isolats, les dosages plasmatiques d’antipaludiques dans le cadre de la surveillance de l’efficacité prophylactique ou thérapeutique des traitements recommandés en France, l’identification, le développement et la validation de nouveaux marqueurs moléculaires de résistance, et la surveillance de la résistance aux antipaludiques en zone d’endémie en relation avec les missions de terrain coordonnées par les autorités militaires.

Informations :

Envoyer un échantillon :

Le protocole de conditionnement et de transport des échantillons est décrit dans la fiche renseignement patient téléchargeable (fiche renseignement patient). Sur demande, nous fournissons tout le matériel nécessaire au conditionnement et au transport des isolats (kit de transport isotherme réglementaire, sonde de température, gelpack, etc). Le transport peut être pris en charge par le laboratoire associé au CNR du paludisme par la société Ciblex.

Tout prélèvement doit être accompagné d’une fiche de renseignement patient téléchargeable (fiche renseignement patient).

Adresse de livraison :

Centre national de référence du paludisme
Unité Parasitologie et entomologie
Institut de recherche biomédicale des armées
IHU Méditerranée Infection
19-21 Bd Jean Moulin
13005 Marseille

Tel : 04 13 73 22 31

courriel : upe.irba@gmail.com

Horaires ouvrables : Du lundi au vendredi : de 8 h 00 – 18 h 00.