L’IRBA s’intègre au pôle scientifique et technique du Grand Paris avec le Genopole d’Evry et le commissariat à l’énergie atomique de Saclay.

L’institut est associé à des établissements réunis au sein de l’alliance nationale de la vie et de la santé (AVIESAN) et développe aussi des partenariats d’ordre académique, dans le cadre d’unités mixtes de recherche (avec l’Inserm, le CNRS ou des universités).

Des partenariats sont conclus avec des organismes internes au ministère (ex : Direction générale de l’armement, Armée de l’air et de l’espace, Marine nationale, Armée de terre, Brigade des sapeurs-pompiers de Paris, Centre national des sports de la défense), des structures étatiques d’autres ministères (ex : INSEP), avec des industriels sous la forme d’accord cadre (ex : Thalès, Airbus), avec des sociétés privées (DREEM, Phymarex) et avec des hôpitaux. Les partenariats concernent également des structures mutualistes (ex : Unéo) ou associatives comme les fédérations sportives.

L’IRBA est membre du cluster GINCO-NRBC (lancé par la DGA maîtrise NRBC), et du cluster Grand Paris Sport.